O percurso de certificação do Sistema Integrado de Gestão da SGEC iniciou há 18 anos, numa das suas antecessoras que, em 2005, obteve a primeira certificação em gestão da qualidade, de acordo com o referencial NP ISO 9001 e, em 2006, a primeira certificação em gestão ambiental, de acordo com o referencial NP ISO 14001, as quais têm vindo sempre a ser a ser renovadas, apesar das alterações orgânicas e de mudanças de instalações.
Em 2024, a SGEC é submetida à 22.ª auditoria externa ao sistema de gestão da qualidade e à 19.ª auditoria externa ao sistema de gestão ambiental.
